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様々な解析結果評価ツール　(Basis, Workstation, Server)

　本プログラムには、複雑なプログラムの利用無しに条件に基づいて解析結果をフィルタリングできる“ Search Filter ”や、質量ピークとアミノ酸の想定質量とのアサインメントの確認を行える“ Fragment Match ”等、様々な視覚化インターフェースを備えています。 アドオンを Server 版に追加すれば、他のプロテオーム解析プログラムを本プログラムからコントロールし、解析結果の比較検討も可能になります。




様々な環境設定インターフェース　(Basis, Workstation, Server)

　分析装置毎の特性や、消化酵素、分子修飾、翻訳後修飾をGUIを通じて簡単に設定できます。また、最新の解析データベースのインストールや機能を追加するアドオンもGUIで操作できます。もう、システム管理者やプログラマーに設定をお願いする必要はありません。




  
 

データマイニングインターフェース　(Basis, Workstation, Server)

  
  　タンパク質同定アルゴリズムは、測定条件や装置の種類、ペプチドの配列長等様々なパラメーターに依存します。当然、全ての考えられうるパラメーターを考慮できる完全なアルゴリズムは存在しないため、得られた解析結果は評価されるべきである。そこで、ProteomicSuite™ は、選択したパラメーターに合わせて解析結果を視覚的に360°観察できるデータマイニングインターフェースを提供します。このインターフェースは、解析結果を評価可能にし、様々な視点から本質的な結果を導きます。  
     
 

カスタマイズ　(Workstation, Server)

　解析に必要な機能の追加や変更を行う ProteomicSuite™ のカスタマイズサービスは、リクエストによって行います。例えば、解析用配列データベースの改良は解析精度と速度の向上に貢献でき、アノテーションデータベースの追加はより具体的な解析結果の評価を実現し、解析結果カラムへの実験時の情報の追加は解析結果のバリデーションを可能にします。つまり、カスタマイゼーションはあなたの研究開発に合わせて、プログラムを改編します。

　また、既に開発された ProteomicSuite™のインターフェースと RDBMS に保存されたデータを利用することで、あなたの研究開発環境に役立つツールが短期かつ低価格に提供することができます。


  
 

タンパク質同定アルゴリズム[特許出願済]　(Basis, Workstation, Server)

  
  　本製品におけるタンパク質同定アルゴリズムでは、配列データより想定されるMSnのフラグメント質量と実際に測定された 質量スペクトルを比較する従来の手法に加えて、装置により検出されやすいイオン特性を検出されるイオン強度により評価することでタンパク質同定に必要となるスコア計算を行います。
　また計算アルゴリズムの特性により発生する偽陽性、偽陰性の見落としを避けるべく、アルゴリズムによりフィルタリングするのではなく、他の同定エンジンの解析結果をカバーできるよう網羅的に解析結果を列挙し、その中から正しい結果を探索する手法を提供します。		  
     
 

統合解析環境　(Server + アドオン)

　Matrix Science 社の MASCOT や The Global Proteome Machine Organization の X!Tandem といったタンパク質同定ソフトウェアに接続可能なアドオンを適用することで、ProteomicSuite™ での解析アルゴリズムと同時に、お手持ちの他の解析ソフトウェアのアルゴリズムを実行させることが可能になります。一旦その全ての解析が終了すれば、ProteomicSuite™の様々なインタフェースを通じてそれぞれの解析結果を比較や統合し解析結果を評価することが可能になります。

　タンパク質同定だけでなく、de novo sequencing や定量解析手法も実行可能なアドオンとして順次公開いたします。（2008年以降）。また、システムバックアップや高速化のためのクラスタ化も、同様にアドオンとして提供いたします。



様々なレポートフォーマット　(Workstation, Server)

　解析結果自身または、“ Search Filter ”に条件を適用することでフィルタリングされた解析結果をレポートとして出力できます。出力フォーマットとしては、タブ区切りテキスト, PDF, Excel, CSV, リッチテキストを選択可能です。


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